JAMBIOは、欧州のマリンステーション連携組織（MARS）、米国のマリンステーション連携組織（NAML）、オーストラリアのマリンネットワーク（TMN）等との国際組織であるグローバル海洋生物学ネットワーク（World Association of Marine Stations; WAMS）に参画し、国際連携を行なっています（https://www.marinestations.org/wams/）。

また、JAMBIO国際シンポジウムでは、WAMSを構成するマリンステーションを中心に、海外組織の代表者や関連する研究者を交え、研究や国際連携に関する議論、交流を行なっています。